古文学派与今文学派，从西汉末年一直延到东汉末年，二百余年间，发生了四次大的斗争，表面上或者为了争官学的地位，或者为了争书籍的真伪。清代后半期也发生同样的斗争。如果比较两派的争论问题，则可得以下几个要点：
1.今文派尊孔子为受天命的素王（素王是未得其位的王），古文派尊孔子为先师；
2.今文派以孔子为托古改制，古文派以孔子是述而不作的史学家；
3.今文派以六经为孔子著作，古文派以六经为古代史料；
4.今文派以《春秋公羊传》为主要凭藉，古文派以《周礼》为主；
5.今文派指斥古文经传是刘歆伪造之作，古文派斥今文经传是秦火残缺之余——今文经传现存《仪礼》、《公羊》、《穀梁》（？）及《小戴礼记》（？）、《大戴礼记》（？）、《韩诗外传》，古文今存《毛诗》、《周礼》、《左传》；
6.今文派相信纬书，以为孔子的微言大义，间有存者，古文派则斥纬书为虚妄。
由以上几点看来，两派不但是所根据的经传版本不同，而且治学态度也相反。今文派虽斥古文经为伪，而本身所根据的经也未必是真，尤其是经说完全由主观造作，发为种种怪异的议论，倾向于迷信与独断。古文派态度比较客观，注重历史的根据，不采神秘怪异之说，故其经说比较接近孔学的真相，但未免过于信古。