李懋桧，字克苍，安溪人。万历八年(1580)进士，授职六安知州，进入京城担任刑部员外郎。
万历十四年(1586)三月，皇帝担心旱灾，命令有关部门陈奏有关方略。李懋桧和部郎刘复初等人竞相说出皇贵妃和恭妃册封的事情，奏章在同一天上交。皇帝发怒了，想重重地处罚他们，但说这事的人还有增无减。阁臣请求皇帝下诏各官衙的建议只限于自己职掌范围内的事情，并且不能够直接上交皇上，以此来安慰劝解皇帝。过了几天，皇帝也息怒了，各疏都被扣留在宫中。而李懋桧的奏疏中又有保养圣体、节制内供、控制近侍、广开言路、放粮赈灾、慎用刑罚、加强检举、限制田制等七件事，也都如石沉大海，得不到实行。
第二年，给事中邵庶在议论诚意伯刘世延时，指责提建议的各大臣。李懋桧上书说：“邵庶因为刘世延的条奏，就波及建议的人，想把他们全都赶尽杀绝。‘防人之口，甚于防川’，邵庶难道没有听说这句话吗？当今天下百姓穷困，财源枯竭，到处都在发生饥荒，山西、陕西、河南，母子离别，满路上都是因饥荒而倒毙的人，疾苦危急的情形，是郑侠所不能描绘的，陛下既听不到也看不见。近来雷击中日坛，星星坠落的有如斗大，上天已发生变异以示警告，京城皇宫之间，儿子杀父亲，奴仆杀主人，世态人情竟如此乖张。邵庶以为四海之内已经无事可说了么？在朝廷的臣子，担任言官的只有十分之二、三。言官不必都是智者，不担任言官的不必都是愚人。且不说过去的事情，就像近年冯保、张居正勾结扰乱朝政，那些接连上疏挽留，歌功颂德，像陈三谟、曾士楚等人，都出自台谏之官，而请拿剑割衣袍、以廷杖贬斥而离职的，不是众位臣僚就是新提拔的书生。如果真如邵庶所说，天子幸而无事还好，假若发生意想不到的变故，陛下如何能够得知。邵庶还以为在朝廷禁止各部建议是好办法，臣恭读《大明律》，上面说百工技艺之人，如果有可以说的事，可以直到皇帝面前报告，如有阻拦的，斩无赦。《大明会典》和皇祖《卧碑》也多次说到此事。百工技艺之人，有建议尚且不敢阻拦，况且各司百官呢？邵庶的建言一旦得以确立，志士就会消失，建议就会逐渐被阻塞，皇上听不到自己的过失，臣子不能够表达忠诚，国家的祸害一定会从邵庶开始。陛下一定要加强百官越权的禁令，不如严格言官失职的处罚。当说不说，判他负君误国的罪行。轻则记大过，重则剥夺官职。科道官的升迁，全看奏章的多少得失为准，那么言官无不直言，庶官无事可言，用不着禁止官员超越职权，天下太平自然会到来。”
皇帝斥责他沽名钓誉，下令贬官一级。科道联合挽救，皇帝不答应。邵庶联合同好胡时麟、梅国楼、郭显忠又轮流上疏弹劾他，于是又降了李懋桧一级官，降为湖广按察司经历。担任礼部主事，因父母丧礼回家，多次被推荐得不到起用，在家里过了二十年，才由原官职被起用。提升为南京兵部郎中。天启初年，死在太仆少卿任上。