侣钟，字大器，郓城人。成化二年(1466)，考中进士。授予御史职务，巡视两淮盐务。在任浙江巡按后回京，负责处理各道的奏章文书。宦官汪直暗示侣钟弹劾大臣马文升，侣钟不同意，于是汪直在宪宗面前进谗言，侣钟遭受廷杖的责罚。后来因都御史王越的推荐，侣钟升为大理寺丞，不久调任为右少卿。
北方游牧部族入侵大同，朝廷讨论派遣大臣巡视保定等府，于是命侣钟负责此项工作。几个月后，侣钟升任为右副都御史，继续巡抚这一地区。河间府濒海地方的民地被权势之家侵占，侣钟夺地还民。后来，朝廷召侣钟回刑部任右侍郎之职。侣钟母亲去世，他租赁漕运船只运母亲灵柩南归。督理漕运的总兵官王信向皇帝报告了这件事，侣钟被逮捕下狱。适逢此时当权者正在排挤朝臣尹..等，而侣钟与尹..是同乡，因此侣钟被贬官二级，降为曲靖知府。后改任徽州知府，不久又入京城任大理寺左少卿。
弘治三年(1490)，侣钟以右副都御史的身份巡抚苏州、松江诸府，致力于救荒赈民。不多时，朝廷召侣钟任户部侍郎总督仓场事务，随即又改任吏部侍郎。十一年，调任为右都御史。两年之后，晋升为户部尚书。
弘治十五年(1502)，侣钟向皇帝报告天下收支的结算情况时说“：衡常收入的赋税，因益蜀免而渐渐减少；日常支出的费用，因请开恩赏赐的增加而逐渐扩大，所以收入不足以应付支出。正统以前军政费用节省，百姓仅输纳国家法定的赋税标准。自景泰年间至今，支出费用日益扩大，正额之外不断加征。河南、山东的边饷供应，浙江、云南、广东的杂办名色，均为过去所无。民众困穷已甚，不能再增加他们的负担了。过去四方丰收，边境不调拨粮饷，州县贫民也无流离迁徙之苦。现今国家仓库已无储备，皇室的储藏也已穷竭，而浮食浮费日益增加。请陛下忧心于此，大力加以减损裁节，并命朝廷诸臣共同探讨增加收入的措施。”孝宗于是下令朝臣讨论此事。朝臣在一番议论后，奏上十二条应对办法，其中罢除传奉冗官，裁汰宫廷滥收的军匠，清理腾骧四卫的冒名勇士，停止寺观的斋醮，减省内侍、画工、番僧的供应费用，禁止王府和织造监过度地乞取盐引，命令有司征收庄田的田租，这些都是权贵佞幸之辈所不满意的。因此奏疏留在宫中数月不予批复，侣钟于是又上疏奏请。上奏终于批复，有关内容同意施行，但事关权贵佞幸利益者竟未获批准。
有奸商投依外戚张鹤龄，请求将长芦旧引票十七万免予追纳盐课，每张引票纳银两五分，再另外如数用钱购买各盐场的余盐，听其贩卖，孝宗同意。后来不法之徒援此成例，请乞两淮盐场旧盐引至一百六十万，侣钟等人坚执不同意，孝宗不予理睬。此后，盐法坏乱，奸人横行江湖，官府无能为力。
东厂特务揭发侣钟的儿子侣瑞接受贿赂，侣钟屡次上疏请求退休，孝宗命以驿车快捷送归。正德时，刘瑾搜集侣钟在户部任职时的“差错”，以致受到三次罚俸的处分。又过了几年，侣钟病逝。