澎湖群岛位于台湾海峡上，东距台湾本岛约50千米，西离中国大陆约140千米，总面积约为128平方千米，向来是扼守中国东南海上通道的重镇，早在唐朝末年就有许多渔民世代居于岛上，中国最晚在南宋时期已派兵在澎湖驻守［楼钥《攻愧集》卷88泉州知府《汪大猷行状》记载：乾道七年（1171）四月，起知泉州，到郡……郡实临海，中有沙洲数万亩，号平湖……”即澎湖的最早官方记录。文章中并记录汪大猷为保护在平湖的汉人不被毗舍耶人（台湾少数民族）劫掠，在平湖造屋200间遣将驻守。］。16世纪，葡萄牙人航行到此，称澎湖为“渔翁岛”，之后荷兰东印度公司两度企图在澎湖建立贸易根据地，但遭明朝驱离。郑成功从荷兰人手中光复台湾后，也在澎湖设置安抚司，清代则改设巡检司。
甲午战争后，澎湖随台湾割让给日本，离开中国版图。日据时期，殖民政府看重澎湖群岛与马公港的军事特性，设置澎湖岛厅，并于1897年改称“澎湖厅”。之后在港口制高点建造一座要塞型建筑，1937年，日本在马公城北墙（现民福路以东）险要之地修筑一座供海军将领与贵族落脚的贵宾馆，取代原先位于马公港畔，较为喧闹的松岛纪念馆。
不过由于地势瓦解、险要尽失，日据政府澎湖厅总务课于1940年改在今日马公市西侧介寿路观音亭附近眺望极佳之地，设计兴建日式木造的第一宾馆；适逢对日抗战爆发，建筑材料采购和运输困难重重，直到1943年2月才竣工，主要作为招待日本皇族及高级军官处所。事实上，当地本是一片墓地，甚至近日还发现清朝同治年间古墓，之所以这么急着改建，主要还是因为地势足以监控马公港与吼门海道，战略意义重大。由于战事吃紧，日本皇族也根本未曾前来贵宾馆落脚。台湾光复后，贵宾馆由国民政府接管，并于1946年改称“第一宾馆”，并修复木制地板，未大幅更动格局，以方便要员入住。只是没想到，就在这段国共内战正酣的时刻，澎湖第一宾馆意外登上政治舞台。
◆地下作战指挥室入口
1958 年“八二三”炮战期间，蒋中正及蒋经国进驻澎湖第一宾馆，并兴建地下指挥中心，借以指挥前线战事，这也是蒋介石众多行馆中唯一一个具有战略设施且“参与”实际战争任务的行馆。指挥中心建于宾馆西侧，入口隐蔽，墙壁厚实，此扇铁门具有军舰门的相同规格，并配备防弹及抽风设备，似有刀枪不入、毒气不侵的能力。蒋介石曾坐镇其中，执行“闪电”“鸿运”“轰雷”计划。（上图）
◆通往地下指挥室的通道
进入地下指挥中心的入口，还有一段长长的通道，顺着阶梯而下，才又到达下一个铁门，可见设计之用心，防备之谨慎。现如今澎湖第一宾馆已向公众开放，地下指挥中心也不再担任作战的指挥场所。狭长的通道与昏黄的灯光，还有重重铁门，让人身处其中就感受到一种神秘、紧张的气氛。（下图）
◆宾馆内部设计
日据时期的诸多建筑风格都采用洋和混合的式样，第一宾馆亦不例外。宾馆内部的空间格局分为待客之用的“洋风空间”和“和风宅邸”两部分，洋风空间有“表玄关（正门玄关、广间）”“应接室（洋式接待室）”和寝室。和风宅邸则有“内玄关（侧门玄关）”和两组“座敷（日式起居室）和次间（座敷续间）”所组成。座敷与次间的隔间拉门是典型的日式拉门，上方设计有木栅窗，采用桧木板镂空雕刻富士山景色的特殊工法，只是年代久远，几经维修之后如今游客已无福欣赏。1956 年澎湖县政府修建时，更改了局部的内部结构，寝室内的榻榻米也被拆除。