隋炀帝的愍皇后萧氏，是梁明帝萧岿的女儿。江南一带风俗，二月里出生的孩子不抚养。皇后正是二月出生的，于是便由她的叔叔萧岌收养下来。不久，萧岌夫妇都去世了，她又被转养在舅舅张轲家。张轲家境贫寒，皇后亲自劳作，生活艰苦。隋炀帝被封为晋王时，文帝替他到梁朝选聘王妃，占卜了几位公主，都说不吉利。萧岿便把萧皇后从舅舅家里接来，来使占卜后，说“：吉利！”于是便册封为王妃。
萧皇后性情温顺，有智谋和见识，喜欢读书，会写文章，颇知晓占候之术(根据天象变化预测吉凶)，隋文帝很喜欢她。隋炀帝也很宠爱和敬重她。当炀帝继位后，便立她为皇后。炀帝每次外出巡游，没有一次不把她带在身边。这时，萧皇后看到隋炀帝已失去当帝王的品德，心里认为这样不行，可是又不敢直说，便写了一篇《述志赋》来寄托自己的感情。
当隋炀帝南下江都时，臣子们都有离叛之心。有宫人对皇后说“：外面传闻人人要谋反。”皇后说：“随你向皇帝上奏。”宫人们对隋炀帝上奏后，炀帝大怒，说“：这不是你该说的。”便把她斩了。后来又有宫人来告诉皇后说“：那些防卫的兵士们都在窃窃私语准备谋反。”皇后说“：天下大事，想不到一朝之间已到这样了，大势已去，难以挽救了。何必再讲呢！只会让皇帝增添忧愁而已！”从此以后再没有人说话了。
当宇文化及叛乱时，萧皇后跟随乱军到达聊城。宇文化及失败后，萧皇后被窦建德抓获。窦建德的妻子曹氏既嫉妒又很凶狠，隋炀帝的嫔妃和美人她都让出家为尼，连皇后也被送往武强县安置。这时，突厥部的处罗可汗实力兴盛，他的可贺敦是隋的义城公主，这时便派人来迎接萧皇后。窦建德不敢强留，萧皇后便带着孙子正道以及一起的女子前往突厥的王廷。大唐贞观四年(630)，击破突厥，便都依照礼节把她们接回送往京城，赐宅院在长安兴道里。贞观二十一年(647)，逝世。传旨以皇后的礼节把她合葬于扬州的隋炀帝陵，加谥号为“愍”。