月合乃字正卿，其祖先属雍古部，后迁居临洮之狄道，金朝占据这个地方，举家又迁往辽东。曾祖帖木尔越哥，在金朝任马步军指挥使，因其官名中有马字，故以马为姓氏。
月合乃好学，不肯屈居人下，父死时他年方十七岁，情绪激昂地说：“我父亲死于国难，我不能解除家难吗！”蒙大军攻陷汴梁，他在战乱的艰苦环境中，保护母亲向北逃亡。在北方，宪宗见他容貌端庄，言辞谨慎，很喜欢他，命他辅助断事官卜只儿，办事处设在燕京城。月合乃以治国为己任，在他的辅助下，各项政务都办得很好。
宪宗二年(1252)，中原地区清查户口，月合乃将读书人家，凡能通一经书者，另立户籍，不与一般百姓混同。元朝读书人免服劳役，实是从月合乃开始的。月合乃好施舍，曾建议设立常平仓。他荐举海内名士如杨春卿、张孝纯之辈，任用于各郡，都说他荐举得当。又聘请名士敬鼎臣来授业为师，荐引马文玉、牛应之等为参佐，这些人后来位至卿相。
宪宗九年，世祖作为亲王领兵南征，月合乃随行至汴梁，专负责军饷，他从济南运来盐百万斤作为公私费用。大军所经过的州郡如汴梁、蔡州、汝州、颍州一带，商农安业，军务政务也办得很好，与月合乃的努力是分不开的。世祖即位后，对他进行褒奖。世祖亲征阿里不哥，月合乃将自己的财产买马五百匹以助军用。世祖对他的家属厚加赡养，说：“这是应当偿还给你的。”拜他为礼部尚书，佩金虎符。
中统四年(1263)，南方与宋交界的边沿地区不宁静，月合乃建议在光州、颍州等处设立两国交易市场，每年可得铁一百零三万七千余斤，用来铸造农具二十万件，以此换取粮食四万石以备官府之用。这样不仅官民两便，而且可与南方宋国和平相处。于是，朝廷诏令他去以本职兼领其事，还召集三千户兴办冶铁事业，在此区域内的蒙古军和汉军都听他调度。但尚未启程就病逝了，年四十八岁。赠推忠宣力翊运功臣、正议大夫、佥书枢密院事、上轻车都尉、梁郡侯，谥“忠懿”。