谢瑜，字如卿，上虞人。嘉靖十一年(1532)进士。由南京御史改任北方的京师御史。十九年正月，礼部尚书严嵩多次被弹劾请求离去，皇帝安慰他并留用他。谢瑜说“：严嵩矫饰浮词，欺君罔上，钳制言官。而且引证明堂大礼、南巡盛事为解，说诸臣之中没有为任事的人，想以此来激怒圣上，他奸状昭然若揭。”皇帝将疏章留下没有发下去讨论。严嵩上奏争辩，而且说：“谢瑜攻击我不止，想和朝廷争胜负。”皇帝于是诘责谢瑜，而特别慰谕严嵩。过了两年竟然用严嵩为宰相。
刚过一个月，谢瑜上疏说：“武庙盘游佚乐，边防按理是被毁坏而没有达到特别被毁坏。现在圣明在上，边防应当巩固却反而被大大地毁坏的原因，在于大臣谋国不忠，而陛下任用人有失。自从张瓒担任中枢，掌管兵务而天下无好兵，选择将领而天下无良将。有人说张瓒形貌魁梧，足以称为福将。如果真是边关无尘埃耸起，海宇冕然，可称之为福。现在张瓒无功而多次被加恩荫，有罪而得不到被革职夺俸，他的这种福只是他一人之福，并不是军国之福。昔年舜诛绝四凶，万世称圣。现在张瓒和郭勋、严嵩、胡守中四人，是圣世的四凶。陛下旬月之间已诛绝其中的二人，天下一致称圣，何不一并将另外二凶流放，以全帝舜之功。大学士翟鸾起于废弃中，授以巡边重任，于是优游嬉戏，浪费供给上亿。以盛行贿赂的人为才，以献淫乐的人为敬，于是致使边军更加贫瘠，边关防备更加废弛。边军若此，将怎么用他们呢？所以不清政本，天下必定达不到大治。不易换本兵，武功必定达不到强劲。”
疏章呈入，皇帝扣留不下发讨论。严嵩又上疏奏辩，皇帝对他更加慰谕，谢瑜又被责备。但这时皇帝虽然向着严嵩，还没有深罪言者，严嵩也因为初得政权，不敢公开排挤陷害，所以谢瑜能够继续担任原官职。不久，严嵩假借其他事情贬谢瑜的官职。又过了三年，大举考察官员，严嵩秘密告诉主持考察的人革除谢瑜。等到疏章呈上，皇帝下令按照贪酷的条例将谢瑜除名，谢瑜于是被废弃。终老死于家乡。
开始谢瑜担任御史的时候，武定侯郭勋陈讲时政，极力诋毁大小诸臣不足以胜任，请求再派遣内侍外出镇守。皇帝听从了他的话。谢瑜抗章上奏说“：郭勋所论奏的各种事情，所指的意向恍惚，但复设镇守，则是他的本意所集中的一点。郭勋交结勾通内侍，代他们营求，以利于他日对他们进行重贿。有言说‘官吏贪浊，是因为陛下没有心腹耳目，人在四方’。又说‘文武之臣怀奸避事，允许内臣劾奏，那么奸贪自息’。如果真的像郭勋所说的，那么内臣当权莫如正德年代时期，这是太平极治吗？陛下革除镇守内臣，确是圣明善政，而郭勋用偏私来诋毁。在朝的百官，谁不是天子的耳目？而郭勋却用不足任来诋毁他们。想让陛下怀疑天下所有的士大夫，唯独倚靠宦官作为心腹耳目，我不知道郭勋将陛下视为什么样的君主？”正巧给事中朱隆禧也对郭勋的事这样说，郭勋的奏请才被止息。谢瑜在隆庆年初期被复官，赠太仆少卿。