汪应轸，字子宿，浙江山阴人。少年有志向操行。正德十二年(1517)成为进士，选为庶吉士。
十四年(1519)皇帝下诏书准备南巡。汪应轸抗言说：“自从下诏书以来，臣民彷徨，不能安居。临清以南，都弃业罢市，逃窜到山谷中去。如果不立即收回成命，恐生不测之变。过去谷永规劝汉成帝说：‘陛下厌恶高美的尊号，喜好匹夫之卑字。多次离开深宫，挺身晨夜，与群小相追逐。典门户奉宿卫的人，拿着干戈而守卫空宫。’这些话切中现实。谷永是谄谀之臣子；成帝是庸暗之君主。谷永这样说而汉成帝宽容他。难道以陛下的圣明，不能俯纳耿直的规劝吗？”疏入，留宫中不发。继而又和修撰舒芬等人一起连章请求这件事。跪在宫殿门口，受杖痛击几乎致死。
训课任务结束后，吏部拟授与他给事中官职，但有圣旨让他出外任职，他于是出任泗州知州。泗州土地贫瘠，百姓懒惰，不懂耕种田地养蚕桑。汪应轸劝他们耕种，买桑苗种植；招募江南的女工，教他们缫丝织布。从此百姓丰衣足食。皇帝正在南征，中使驿车骚扰道路。汪应轸率领青壮男子一百多人排列水边，船到后，立即挽住皇帝出境。皇帝车驾驻住南京，命泗州送进的善歌舞管奏之美妇有数十人。汪应轸说“：泗州子女粗鄙丑陋，不能称皇上圣意。我先前招募有桑妇，请皇上将她们收纳在宫中，传授蚕事。”事情才止息。
世宗即位，召封他为户科给事中。山东矿盗兴起，抢掠东昌、兖州，流入畿辅、河南境内。汪应轸上奏说：“消弭强盗与抵御敌寇不同。抵御敌寇的办法，是将他们驱逐到境外而已。如果消弭强盗而纵使他们出境，就是嫁祸给邻国。凡一方有警，不实行扑灭，导致延蔓他境的人，都应当重重论罪。”皇帝答复准可。在户科一年多，共上疏三十多次，都切中时弊。后为便于养亲，乞求改派南方，于是调到南京户科。张璁、桂萼在南部，正提议追尊献皇帝。向来知道汪应轸名气，想倚靠他帮助自己。汪应轸与他们的提议不合，立即上奏请求遵循礼经、崇尚正统，以安定人心。皇帝不表态。
嘉靖三年(1524)春天，他出任江西佥事。过了二年，上疏称病，不等到命令下来就回家乡，被巡按弹劾。皇帝诏令所司逮捕查问。汪应轸说自己双亲已老，缺少兄弟，乞求休假侍养老人。吏部也为他请求，才免去逮捕。过了很久，廷臣交互推荐他，以原官起用，巡视江西学政。不久因父丧回到家乡，后病死。