清代道、咸、同三朝“筹办夷务始末”有关台湾的史料，“文丛”已分别编有“筹办夷务始末选辑”（第二○三种）及“同治甲戌日兵侵台始末”（第三八种）两书印行。新近中央研究院近代史研究所出版“道光咸丰两朝筹办夷务始末补遗”及“四国新档”两书，均另有补充前编“选辑”的资料。“补编”之辑，即基于此。
“道光咸丰两朝筹办夷务始末补遗”是新编的史料，原由已故的蒋廷黻先生于民国十九年选自北平大高殿所藏清代军机处档案，中央研究院近代史研究所今据现任美国哈佛大学教授费正清（ＪｏｈｎＫｉｎｇＦａｉｒｂａｎｋ）所存选抄本编印成书（其经过见原书费正清、郭廷以两序）。按蒋氏所选原抄本前藏国立清华大学图书馆，惜于民国二十六年芦沟桥事变后，已不知其下落。费氏所存选抄部分（始于道光二十二年、止于咸丰十一年），计八百二十六件；经近代史研究所删去与道、咸两朝“筹办夷务始末”及“四国新档”完全重複者一百十八件，实得七百零八件。现存之件，有可作上述“筹办夷务始末”补正者，亦有为“完全新发现”者（郭序语）。本书所选，有两件係与前编“选辑”“有出入”（即非完全重複），馀均为“完全新发见”文件。内容所涉，主要为关于道光年间中英鸦片战争一役所谓“台湾杀俘”事件，次为咸丰年间与英、法、美、俄签订天津及北京条约后台湾开港问题交涉事。就文件性质而言，以与有关国家使臣往来照会等件为多。此外，另有两件台湾船厂修造战船动支银两的资料，一并选入。
“四国新档”係咸丰九年军机大臣奉旨纂辑的，起自道光三十年、讫于咸丰九年，至同治二年完成。原编计有“英国档”二十卷、“法国档”二卷、“美国档”四卷、“俄国档”二十卷，合共四十六卷。这一“新档”纂于道光朝“筹办夷务始末”（自道光十六年至二十九年）之后，根据军机处原档编录，仅备考查之用，与后来成书的咸丰朝“筹办夷务始未”微有不同。近经近代史研究所将所藏清季总理各国事务衙门录存的清档（即誊清本）与另一题为“办理抚局”的清档合编印行。据与“筹办夷务始末”核对结果，重複者佔三八．四一％，稍有出入者佔八．二○％，有出入者佔一二．七八％，新刊布者佔四○．六一％；换言之，全书约有十分之四为“筹办夷务始末”所未收。本书所选，计有“英国档”与“美国档”各若干件，大体均为“有出入”者或“新刊布”者；偶有“稍有出入”与“重複”者，亦止于有所需而选（“法国档”与“俄国档”因无“新刊布”与“有出入”者，故未列选）。“英国档”所选为道光三十年及咸丰八、九年间英人欲在台湾购煤及迳赴贸易等事，“美国档”所选则全属咸丰九年换约后美人请在潮州与台湾两地先行互市交涉文件；尤以后一档所录往来照会，殆均为“新刊布”者。
本书按所据分为“道咸两朝筹办夷务始末补遗”、“英国档”、“美国档”三部分，依次编列。又为便与前编“选辑”互阅，每件文首均如“筹办夷务始末”冠以军机处存档登记月日；按日检对，即可见其先后。凡原为一个文件（如奏摺与附摺）分作数件者，今仍合併编列；例如“补遗”所选道光二十二年十一月二十四日浙抚刘韵珂奏，已将另列之所谓“■〈口僕〉■〈口鼎〉喳晓谕”併附。其正件已见前编“选辑”者，则加注说明；例如“美国档”所选咸丰九年九月初九日钦差大臣何桂清奏所附与美使往来照会，即于月日下注以“文见“筹办夷务始末选辑”卷二同日“钦差大臣两江总督何桂清奏”，以下为其附摺--与美使往来照会”。至卷首所编目录，于“存档登记月日”以外，并摘记各件事由，以见其概（伯琴）。