曹丕原来的身份是魏王兼汉廷的丞相，禅让之后许县的汉朝廷、邺县的魏王府和丞相府都不存在了，所有人员统一归入新朝廷。曹丕不打算再为新朝廷设置丞相，放眼曹魏内部似乎也没有能担此重任的人选，更为重要的是，设不设丞相体现着君权的强弱，曹丕要做强势君王，不需要给自己的下面再培养出权臣。
丞相不设，三公还是要设的，后汉的三公是太尉、司徒和司空，曹丕沿袭了旧制。在人选上，曹丕第一个想到的是杨彪，弘农郡杨氏是前朝最著名的政治世家之一，杨彪的父亲是汉灵帝的老师杨赐，父子二人在士人中均深得厚望。
曹丕派人去请，却被杨彪一口回绝了。儿子杨修被杀后杨彪仍心有余悸，不再过问任何政治，他对来人说：“我也当过汉室的三公，愧疚的是没有建立尺寸之功，如果再当魏朝的三公，对国家来说并不是什么可称道的事。”曹丕深感遗憾，改拜杨彪为光禄大夫，品秩二千石，相当于部长级，属于荣誉性质，又赐给杨彪延年杖、冯几，特许他上朝时穿单衣、戴皮弁帽，站位仅次于三公，又在杨府门前设行马，置吏卒警卫以示优崇。
清心寡欲、不问世事的杨彪最后以84岁的高寿而终，死后归葬于家乡弘农郡的杨氏宗族墓。杨彪的曾祖杨震被称为“四知先生”“关西孔子”，那句“天知、地知、你知、我知”的话就出自他，杨氏宗族墓目前仍保存着杨震、杨彪等家族成员墓七座，具体位置在今陕西省潼关市吊桥镇，黄河在潼关拐了个弯儿，杨氏宗族墓就在拐弯处的黄河边上，由于“四知先生”的事迹，这里被建成了一处廉政教育基地。
杨彪不愿意干，下面就是钟繇、程昱、华歆、王朗、贾诩等几个人，他们的名望和资历都差不多。钟繇、程昱追随曹操的时间最长，他们屡建奇功，是能武又能文的重臣；华歆、王朗在社会上声望颇高，也是先帝手下的名臣；贾诩智慧过人，是为数不多的几个深为曹操所佩服的人，在曹丕立太子过程中发挥过重要作用。
经过权衡曹丕最后选贾诩为太尉、华歆为司徒、王朗为司空，钟繇、程昱虽然是曹魏的“嫡系”，但都因为各自原因而落选。
程昱的落选还是当年的“人脯”事件，他曾把人肉干当成军粮，在儒家看来只有禽兽才吃人肉，程昱因此备受诟病，之前已多次与三公之位无缘，新朝廷要展示新形象，尽管程昱在别的方面无可挑剔，曹丕还是不敢用他。曹丕让程昱担任九卿之一的卫尉，相当于京城警备司令，负责洛阳的保卫工作。程昱活到了80岁，死后追赠为车骑将军。
钟繇的落选是因为不久前发生的魏讽谋反事件，魏讽是他的下级，钟繇因渎职而被处分，免去了职务，曹丕继魏王后刚刚复起钟繇为魏国大理寺卿，马上就出任三公不太合适。曹丕继续发挥钟繇的特长，任命他为九卿之一的廷尉，相当于司法部部长。钟繇这位书法家活到了79岁，死后被追赠为太傅。
曹丕对三公的人选很满意，有一次罢朝后看着他们的背影高兴地对左右说：“你们看看这三位，都是一代最杰出的人物啊，以后估计再也难以超越他们了！”三公以下是九卿，已有程昱、钟繇两位，剩下的由董昭、和洽、邢贞等人充任，他们也都是老臣，追随曹操多年，立过各种功劳。
从曹丕的新班底来看似乎用的都是“老人”，其实并非如此。
这是因为，三公九卿并不是曹丕人事布局的重点，真正的权力核心在尚书台。汉武帝刘彻创设尚书台的目的是分丞相、九卿的权，这个机构相当于朝廷的秘书局，不仅负责处理中央各衙署之间、中央与各州郡之间的公文往来，还参与各种重大决策的制定，是真正的权力核心。曹丕基本沿用了汉朝尚书台的设置，长官为尚书令，副长官为尚书仆射，下设若干名尚书。
曹丕选的尚书令是桓阶，尚书仆射是陈群和邢颙，另选司马懿、陈矫、卫觊、崔林、杜畿五人为尚书，这才是新朝廷真正的班底。
相比于司马懿、陈群，桓阶这个名字有些陌生，之前对他也介绍过一些。他是荆州刺史部人，经历颇为传奇，早年他曾在孙坚手下干过，得到过孙坚的赏识。孙坚死后他冒险发丧，又被刘表欣赏，刘表想把妻妹嫁给他，被桓阶拒绝。官渡之战时桓阶策动荆州的江南几个郡反叛，牵制了刘表，此举被曹操视为官渡决胜的关键之一，曹操南下荆州后即把桓阶找来延至麾下，十分信任。曹丕重用桓阶的原因之前其实已经提到，在夺嫡之争中桓阶坚定地站在曹丕一边，与其他人不同的是，他不仅表态支持曹丕，而且不顾猜忌，多次主动地向曹操密谏，认为曹丕德优龄长、宜为储副，每次态度都十分坚决恳切，曹丕对他深为感激。
与桓阶一样，邢颙也是著名的“太子党”，他最早其实在曹植的平原侯府任职，但他看不惯曹植，与曹植性情不合，后调离平原侯府，看到曹操有“废长立幼”的打算，邢颙也多次劝谏。
陈群和司马懿更不用说了，是曹丕的“死党”，让他们一个担任尚书仆射、一个担任尚书，主要考虑到他们的名望、资历还较浅，需要一个培养的过程。陈矫、卫觊、崔林、杜畿等人则是有名的实干家，他们都在地方上任郡太守多年，很有业绩，了解下面的情况。
曹丕为自己打造的这个核心班底，是由绝对信任的人和实干家组成，是一个有实力、信得过的班子。
桓阶身体不好，第二年便去世了，陈群和司马懿于是各升一级，一个担任尚书令，一个担任尚书仆射。又过了一年，邢颙改任司隶校尉，司马懿成为朝廷秘书局的尚书左仆射，杜畿升尚书右仆射。
至此，曹丕在政务方面的左右手分别到位，陈群和司马懿这两个政坛新星冉冉升起。
在军事上，与魏王时期相比也有一些新变化。
夏侯惇死后，他所担任的大将军一职空缺，按说应该由现任军职最高的曹仁补上，但曹丕没有表示。曹仁仍任车骑将军；曹洪任卫将军，不过只是挂个名。
前、后、左、右将军分别任命了张辽、张郃、徐晃、朱灵，他们四人随便拉出来一个都是响当当的一代名将，为曹魏大业连年征战，肝脑涂地，屡建殊功。典韦、许褚战死了，不然轮不到朱灵，还有一位本应是四方将军中的第一位，但兵败降敌，关羽被杀后又被“接管”到了孙吴，这就是于禁。
上面都属“论资排辈”，再往下就是“诸夏侯曹”第二代年轻将领的天下了，曹真、曹休以及夏侯渊的儿子夏侯霸、夏侯威，侄子夏侯尚，夏侯惇的儿子夏侯楙等纷纷脱颖而出，迅速走向前台，逐渐从父辈们手中接过兵权。
曹真担任镇西将军，坐镇关中一带，他成为曹魏西线战场的总指挥；曹休开始担任领军将军，是禁军的统领，不久晋升为镇南将军，成为曹魏中线战场的总指挥；夏侯尚开始担任中领军将军，也是禁军的首领之一，很快就晋升为征南将军，成为进步最快的一个。夏侯楙后来担任了安西将军，夏侯霸、夏侯威担任了右将军，在曹丕的提携下他们都迅速成长起来。
文有陈群、司马懿，武有“诸夏侯曹”第二代，这就是魏文帝曹丕总体的人事布局。
对曹植、曹彰等这些兄弟，曹丕的政策是分散遣送到各地，理由是他们都有各自的封地，现在应该到那里去。为了加强对这些兄弟的控制，曹丕还专门给每个人派去一名特派员，负责监督封国的情况，发现问题可以直接向曹丕报告。
自从曹丕被确立为太子，曹植就承认了失败，别人上劝进表，他也上了一份，曹丕让他们就国（当随例），他乖乖去了平原国。曹丕派去监督曹植的人名叫灌均，此人为迎合曹丕，上表密奏说曹植酒后行为不端，还劫持威胁朝廷特派员，有关部门随即上报请求治曹植的罪，曹丕本想给予严惩，后在太后的干预下仅作贬爵为安乡侯的处罚。
为防止被天下人议论，曹丕还特意下诏说：“曹植是我一母同胞的兄弟，我对天下都无所不容，何况曹植呢？骨肉之亲哪里舍得杀害？所以予以改封。”
在野史里记载了一件事，说曹丕称帝后对曹植仍心怀忌恨，有一次命曹植在七步之内写出一首诗，如做不出来就将行大法处死，但曹植不等其话音落下便应声而出：“煮豆持作羹，漉菽以为汁。萁在釜下燃，豆在釜中泣。本自同根生，相煎何太急？”这首诗又被小说家演化为只有四句的《七步诗》，知名度很高。但曹丕称帝后他们兄弟二人见面次数极为有限，曹丕拿作诗这种小把戏为难诗才横溢的弟弟，于情于理于客观情况都不大可能。被贬后曹植很快又被改封为鄄城侯、鄄城王，一直过着心惊胆战的日子，遇事无不小心谨慎。
有一次曹植奉诏入京，快走到洛阳时突然内心里感到了无名的惊惧，就丢下随行人员骑马微行入京，他偷偷地去见了大姐清河长公主，想让她带着自己到哥哥面前请罪。
曹植不见了，关吏不敢怠慢马上报告，曹丕派人沿着来京的路线搜寻，没有找到。太后听说后认为曹植自杀了，在曹丕面前痛哭。过了一阵曹植散着头发、光着脚并且自行背负刑具来了，太后才转悲为喜。曹植后来又被改封为雍丘王、东阿王，不仅有人监管，而且封地也变来变去，日子很不好过。
曹植的哥哥曹彰也没好到哪里，曹操在时封他为鄢陵侯，曹丕称帝后晋升他为公爵。曹彰本以为自己与其他兄弟不同，他带过兵，对国家有用，所以应该另有安排，但诏书下来他也跟兄弟们一样就国。曹彰很不高兴。鄢陵这个地方也不好，属经济落后地区，曹彰想改为中牟，这里不仅经济发达而且离洛阳不远，曹丕答应了，封他为中牟王，但不久就改封为任城王。曹植奉诏入京的那一次曹彰大概也来了，但他却莫名其妙地暴死在洛阳。
有野史说，曹丕邀曹彰在卞太后那里下棋，一边下一边吃枣，曹丕把毒药弄在枣蒂中，自己只吃没毒的，曹彰不知道结果中毒。卞太后拿水想救他，曹丕早已密令左右把瓶罐都毁了，卞太后急得只能光着脚跑到井边想去取水，可水还是没打上来，过了一会儿曹彰就死了。
这个记载也不足信，曹彰是不是曹丕杀的先不论，即使是，曹丕杀个人也不必费这么大的事，更不会当着母亲的面，这个记载与《七步诗》一样都属于杜撰。
不过，曹丕称帝后曹彰、曹植以及其他几位宗室的处境确实很不好，遣散出京、一再迁封，内部又有人监视，过的日子连普通人都不如。