同伴神秘失踪
四个人按照计划进入雨林区域后，果然发现到处是险峰峡谷，茂密的丛林遮天蔽日，大大小小的河流瀑布穿流于其间，犹如来到了侏罗纪时代的森林公园一般。喜爱植物学的莫莎和燕妮两个女生抓住这难得的机会，尽可能地往她们背包里采集更多的奇花异草标本。而桑布和雷萨尔只顾忙于用相机捕捉大自然所造化出的瑰丽奇景。
一天，四个人发现了一处地形构造复杂奇特的幽深峡谷，决定进入其中游览一番。不巧的是，莫莎不慎扭伤了脚，痛得无法正常走路。协商后，由燕妮留下守在帐篷里护理莫莎，桑布和雷萨尔则继续进入峡谷深处，并且相约一天内就返回临时营地与燕妮、莫莎会合，然后共同踏上归程。
燕妮与莫莎足足等了一整天也未见两个男同伴身影再现，她们的心不免开始忐忑起来。结果又过了两天，仍然不见他们的影子。两个女孩再也沉不住气了，猜测同伴十有八九发生了不测。在莫莎脚伤稍微好转后，燕妮搀扶着她沿着来路找到了离此最近的一个土著人村落。
淳朴热情的村长听明白她们的来意后，表示愿意鼎力帮忙。于是，燕妮暂时把莫莎安排在村里住下，自己和村长及几名熟悉地形的猎人马上出发了。
令燕妮深感诧异的是，当她把众人带至两个男同伴失踪的那处峡谷边缘时，猎人们竟裹步不前，纷纷面有惧色地望着村长。村长的脸色也变得极为难看，不得不郑重地告诉燕妮：“你的同伴们进入的是一个可怕的死亡之地，恐怕没有解救的希望……”
通过村长惊惶不安的介绍，燕妮这才知道，这是一处充满死亡气息的峡谷，凡是人和动物进入其中几乎没有能活着走出来的，因此被当地人称为“幽灵谷”。尽管燕妮再三哀求，村长仍决然地摇摇头，还中肯地警告燕妮，那两个同伴即使没死恐怕也早已被幽灵附体了。燕妮没有办法说服这些对幽灵谷谈之色变的土著人，不得不以最快的速度回到首都塔那那利佛，通过西班牙驻在那里的外交机构联系了一架直升机，飞到幽灵谷上方实施搜索救援。
死者看到“鬼魅”
直升机在峡谷区域盘旋了大半天，终于发现了昏倒在一处小溪边的桑布和雷萨尔。等把两人送到首都医院时，桑布已经气绝身亡，而雷萨尔也处在奄奄一息的边缘。燕妮一边给他们的教授托马斯打电话告知情况，一边查看了桑布留下的日记，里面写道：“我和雷萨尔进入的简直就是一片毛骨悚然的坟地，到处都是累累白骨，而且陰风惨惨，此起彼伏的哀号声像是有鬼魅在诉说着无尽的冤屈……夜深了，周围黑得伸手不见五指，忽然间有星星点点的光从远处闪现出来。不一会儿就汇合成一大团一大团的红光，像是传说中的幽灵张牙舞爪地朝我们所处的位置飘过来。我们恐惧地想逃，可是两条腿已软得不听使唤，如同中了什么魔法一般只能停留在原地……”
桑布的日记到这里便结束了，燕妮看完后禁不住战栗起来：难道那处峡谷真有可怕的幽灵出没？如果它不是事实，那么桑布日记里留下的这些真实记录又该怎么解释呢？
就在燕妮百思不得其解之际，噩耗传来，一直处于昏迷中的雷萨尔因抢救无效死亡。更令人惊悸的是，就在他死亡前的几分钟，有值班护士居然看见他嘴里向外缓缓吐着荧光，仿佛是一个隐身的鬼魂附在体内作祟一般。
等托马斯教授和助手们匆匆赶到时，燕妮哭诉了这一切离奇的遭遇。学识经验异常丰富的托马斯一方面安慰燕妮，一方面亲自前往那处幽灵谷考察。仍然是在莫莎停留的土著人村落里，托马斯向村民们详细询问了情况，得知数百年前该峡谷曾是统治这座岛屿的一个奴隶制王国处决犯人的地方。士兵们每每把成批的犯人饿上几天几夜后赶入峡谷里，居然从没有见到一个幸存者活着走出来，因此便视其为地狱入口。那些死去的冤魂等到年深日久便会幻化成幽灵，等到月隐天黑之际就结群出来游荡，以索取进入这里的所有生灵的性命来求得超生。
教授捕捉“幽灵”
诡异的传说让助手们不禁替托马斯教授暗暗捏了一把汗，劝说他不要冒这个险。但是托马斯微微一笑：“我会努力用事实揭开幽灵谷秘密，还人们一个科学真相的！”
托马斯凭借多年的野外探险考察经验，迅速从国内运来一批探测仪器和防毒面罩给自己和助手们武装好，然后向着幽灵谷进发了。说来也怪，他们一行人顺利到达峡谷深处时，并未遇见过任何邪恶的幽灵。托马斯等人采集了不少土壤样本，到了夜里就在白骨累累的溪涧边支起帐篷宿营。
当月亮隐进云层的时候，空气显得异常闷热，显然是一场大雨将要来临的征兆。就在这时，一个助手突然指着远处黑黢黢的树林方向惊叫起来：“看啊，幽灵……幽灵出现了！”众人循声望去，的确是土著人传闻中的可怕现象发生了。只见越来越多的红光渐渐汇合到一处，随着风向朝营地位置缓慢飘荡过来。托马斯吩咐众人戴好防毒面罩，助手们甚至将防身猎槍子弹上膛以备不测。谁知那些成团的红光未等飘至近前，便仿佛惧怕了一般，随着不时改变的风向又向别处移走了。
托马斯和助手们用过滤器搜集了不少红光“走”过的地段残留的空气后，面带满意的微笑说：“现在我们已经捕捉到了足够的‘幽灵’，可以回去让它们现身了！”
死者嘴里的红光是何物
托马斯教授归来后经过一系列化验，再结合桑布和雷萨尔的尸检结果，终于将幽灵谷的真相大白于天下。原来，它是世界上一处极其罕见的黄磷矿集中分布带，土壤中含有非常丰富的黄磷，这些对于人和动物来说有毒的磷元素可以被植物根系吸收，也容易污染峡谷区的任何水源。过去被赶至这里饥不择食的犯人们当然要吃树上的野果和喝溪涧里的水，从而引起磷中毒死亡。
桑布和雷萨尔也是进入峡谷区时，误饮了看似清澈实则有极高浓度黄磷的溪水。磷中毒后的症状是头晕脚重，双腿无力迈不动步子，故桑布留下的日记会真实记载这种情形。至于大团大团的红光也并不是什么幽灵再现，而是人和动物骨骼中的磷不时挥发到空气中，遇到湿热条件时便会产生自燃。待这种磷气体越聚越多时，便会由星星点点闪烁的微光形成团团红光。由于磷比空气轻，红光自然要随着风向移动。但是只有等到月隐天黑时，人们才能完全看清这种磷大面积自燃的情景。
桑布遗留日记中提到的陰风惨惨和鬼魅哀号现象，实则是磷与湿润空气中的水分子产生化学反应，生成磷化氢等物，它们在自燃时能够发出可怕的声音。雷萨尔生前体内呼吸进这种含有高浓度磷的空气，接受医院抢救时身体受药物作用，通过口鼻排出了一部分磷，这些磷分子在重症监护室里与温暖湿润的空气相作用发生极轻微自燃反应，从而使得护士在相对较暗的环境状态下能够看到雷萨尔嘴里闪着红色的荧光。